生信技能33 - gnomAD数据库hg19/hg38 VCF文件批量下载脚本

news2025/1/10 23:40:50

gnomAD数据库下载地址

gnomAD downloads

gnomAD v2.1.1数据集包含来自125，748个外显子组和15，708个全基因组的数据，所有这些数据都映射到GRCh 37/hg 19和GRCh 38/hg 38 两个版本的参考序列。

gnomAD hg19

gnomAD数据库hg19与hg39 VCF文件批量下载脚本

download.sh

# 获取当前目录路径，下载文件至当前目录
current_dir=`pwd`

# 下载参考基因组对应的vcf
genome_version = 'hg19'

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