【教程】cpp转python Nanobind 实践 加速轻量版 pythonbind11

news2024/11/16 7:22:51

主要是尝试一下把c++这边的函数封装打包给python用,选择nanobind的原因是:1. 优化速度快,2. 生成二进制包小,不过pythonbind11是更为广泛知道的,nanobind也是pythonbind11作者后续做的,可以查看作者写的 why another binding libaray?

总结一下就是:nanobind 同样是一个用于创建 C++ 和 Python 之间绑定的工具,它的目标是简化和加速绑定生成过程。与 pybind11 相比,nanobind 的不同之处在于它专注于 较小的 C++ 子集,提供更高效的内部数据结构和性能优化,并引入了一些便利性和质量改进的新功能。

参考资料:

  1. official code: https://github.com/wjakob/nanobind
  2. official docs: https://nanobind.readthedocs.io/en/latest/
  3. 非常简单的示例:https://github.com/wjakob/nanobind_example/tree/master
  4. 本篇博文的示例代码:dztimer (which 耗时 小张同学 3小时找bug)

1. 安装 Install & 查询 Find

注意不同的安装方式在 cmakelist.txt 的写法会不一样,下面会分别举例:

# 1. pip install
python -m pip install nanobind
# 2. conda install
conda install -c conda-forge nanobind
# 3. from source
git submodule add https://github.com/wjakob/nanobind ext/nanobind
git submodule update --init --recursive

那么对应 如果是 1/2 方案则需要走到Python executable去寻找

# Detect the installed nanobind package and import it into CMake
execute_process(
  COMMAND "${Python_EXECUTABLE}" -m nanobind --cmake_dir
  OUTPUT_STRIP_TRAILING_WHITESPACE OUTPUT_VARIABLE NB_DIR)
list(APPEND CMAKE_PREFIX_PATH "${NB_DIR}")
find_package(nanobind CONFIG REQUIRED)

第三方案则是直接定位到那个clone下来的repo

add_subdirectory(${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/ext/nanobind)

2. 初步尝试

此次直接copy的官方文档的方案进行快速尝试

两个文件即可:

  1. 新建一个my_ext.cpp

    #include <nanobind/nanobind.h>
    
    int add(int a, int b) { return a + b; }
    
    NB_MODULE(my_ext, m) {
        m.def("add", &add);
    }
    
  2. 新建一个CMakeLists.txt (注意因为我直接pip install的所以选用的是方案一进行的nanobind的查找)

    project(my_project) # Replace 'my_project' with the name of your project
    cmake_minimum_required(VERSION 3.15...3.27)
    find_package(Python 3.8 COMPONENTS Interpreter Development.Module REQUIRED)
    
    if (NOT CMAKE_BUILD_TYPE AND NOT CMAKE_CONFIGURATION_TYPES)
      set(CMAKE_BUILD_TYPE Release CACHE STRING "Choose the type of build." FORCE)
      set_property(CACHE CMAKE_BUILD_TYPE PROPERTY STRINGS "Debug" "Release" "MinSizeRel" "RelWithDebInfo")
    endif()
    
    # Detect the installed nanobind package and import it into CMake
    execute_process(
      COMMAND "${Python_EXECUTABLE}" -m nanobind --cmake_dir
      OUTPUT_STRIP_TRAILING_WHITESPACE OUTPUT_VARIABLE NB_DIR)
    list(APPEND CMAKE_PREFIX_PATH "${NB_DIR}")
    find_package(nanobind CONFIG REQUIRED)
    
    nanobind_add_module(my_ext my_ext.cpp)
    
  3. 搞定,就在此文件夹目录下 终端输入:

    cmake -S . -B build
    cmake --build build
    
  4. 运行

    cd build
    python3
    
    Python 3.11.1 (main, Dec 23 2022, 09:28:24) [Clang 14.0.0 (clang-1400.0.29.202)] on darwin
    Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
    import my_ext
    my_ext.add(1, 2)
    3
    

至此你完成了一个cpp转python的(感觉这里好像没啥好解释的,看起来就非常易懂,但是!自己操作起来就是另一回事了 欢迎尝试:

3. 复杂尝试

如果感兴趣可以自己先开始干,这是Daniel在ufomap里写的一个timer.hpp文件 [请遵循许可证使用],内含一个巨好用的 Timer 类,一应俱全,正常C++的使用方式是

#include "timing.hpp"

Timing timing;
timing.start("Total");
timing[0].start("One Scan Cost");
// do something.
std::cout<<timing[0].lastSeconds()<<std::endl;
timing[0].stop();

timing[6].start("Write");
// do write file function
timing[6].stop();
timing.print("MyTest" /*title*/, true /*color*/, true /*bold*/);

源码 click here: timing.hpp

那么我们同样想在python里使用这个类,需要用pythonbind11或者nanobind进行搭桥,假设我们python的使用要求如下:

import dztimer
from time import sleep

if __name__ == '__main__':
    timer = dztimer.Timing()
    print(timer)
    timer.start("Total")
    timer[0].start("One Scan Cost")
    for i in range(5):
        sleep(0.05 + i * 0.01)
    timer[0].stop()
    
    for i in range(5):
        timer[1].start("Second Scan Cost")
        sleep(0.08 + i * 0.01)
        timer[1].stop()
    timer.print(title="MyTest", random_colors=True, bold=True)

—— 华丽的分割线 ——

以下为答案部分(不唯一)

#include "timer.hpp"
#include "nanobind/nanobind.h"
#include <nanobind/stl/string.h>

NB_MODULE(dztimer, m) {
    nanobind::class_<Timer>(m, "Timer")
        .def("start", static_cast<void (Timer::*)()>(&Timer::start))
        .def("stop", &Timer::stop);

    nanobind::class_<Timing, Timer>(m, "Timing")
        .def(nanobind::init<>())
        .def(nanobind::init<const std::string &>())
        .def("start", static_cast<void (Timing::*)(const std::string &)>(&Timing::start))
        .def("start", static_cast<void (Timing::*)(const std::string &, const std::string &)>(&Timing::start))
        .def("__getitem__", static_cast<Timing& (Timing::*)(std::size_t)>(&Timing::operator[]), nanobind::rv_policy::reference)
        .def("print", &Timing::print, nanobind::arg("title")="Default", nanobind::arg("random_colors")=false, nanobind::arg("bold")=false, 
             nanobind::arg("group_colors_level")=std::numeric_limits<std::size_t>::max(), nanobind::arg("precision")=4);
}

接下来开始从 小张 遇到的一个个bug开始讲起:

Class parent children

如果你要使用的对象是从父类里继承的,那么!分类也要在nanobind里申明!! 这就是为什么小张同学直接call stop的时候 说找不到,所以需要也把父类expose出来

string

#include <nanobind/stl/string.h>

这个是报错,然后一脸懵逼 直到chatgpt也无能为力 让我试试最简单的例子,也就是print hello 才发现原来是…. 头文件没加,也就是说如果你的输入参数有std::string 类型 你应该要带上这个头文件 不然会运行报错如下:

Invoked with types: nanobind_example.Timer, str

然而还是自己看文档这个部分发现不同 无意看到想着加一个试一下 然后就好了…

更多std::的其他函数可能也有这个需求 可以看官方文档的这个include 获取:https://github.com/wjakob/nanobind/tree/master/include/nanobind/stl

[] 操作符重载

其实其他的都有 唯独这个没有,后面才知道原来不需要在python里重载这个 而是用get_item去做这件事,对应的issue还是从pythonbind11里找到解答的:https://github.com/pybind/pybind11/issues/2702

所以最后才写成了

.def("__getitem__", static_cast<Timing& (Timing::*)(std::size_t)>(&Timing::operator[]), nanobind::rv_policy::reference)

Ownership

也就是getitem的时候 之前直接这样写的:

.def("__getitem__", static_cast<Timing& (Timing::*)(std::size_t)>(&Timing::operator[]))

but 不报错 但是结果是错的,也只能给出Total的结果,所以很难找到原因,只能求助chatgpt,然后给了一个不存在的方案 但是灵机一动 搜一下最后的nanobind::return_value_policy::reference refernce,发现其实差一点点 他就对了(可能是因为pythonbind11训练样本更多吧

.def("__getitem__", static_cast<Timing& (Timing::*)(std::size_t)>(&Timing::operator[]), nanobind::return_value_policy::reference)

也就是在nanobind的 **ownership章节,提到了类似的:**

Data data; // This is a global variable

m.def("get_data", []{ return &data; }, nb::rv_policy::reference)

所以一修改 哦吼就好了!

4. 本地安装 与 本地上传 pip

本地的话,建议看一下 dztimer repo 所有的代码,以便漏掉了某个环节

首先是本地可能需要venv去隔离开环境,比如提示我先安装这个py3.8环境:

sudo apt install python3.8-venv

然后在对应 dztimer 文件目录下运行:

python3 -m pip install --upgrade build
python3 -m build

打印信息如下,也就是你得到了一个dist文件夹下有库的二进制包了

接下来是了解怎么从本地push上去。管理pip install的是pypi这个组织,然后旗下可以先走testpypi

步骤是:1. 注册账号,2. 验证邮箱,3. 转到api-tokens创建API,4. 设置为整个账户,5. 保存到本机上方便上传

接下来,我们需要上传我们的release。为此,我们必须使用上传工具来上传我们的包。PyPI 官方上传工具是twine,所以让我们安装 twine 并在该dist/目录下上传我们的发行版档案。

拿到API token后 set up your $HOME/.pypirc file like this:

[testpypi]
  username = __token__
  password = pypi-AgENd???

然后文件目录下终端输入:

python3 -m pip install --upgrade twine
python3 -m twine upload --repository testpypi dist/*

然后就是提交上去啦 如下就可以看到公开的一个link

现在可以换个环境下载一下这个包进行使用:

python3 -m pip install --index-url https://test.pypi.org/simple/ --no-deps dztimer

但是需要注意的是 你可以看到编译的只有当前环境的py38和 manylinux,所以还需要走到下一步 也就是使用github action的功能来对所有系统 所有版本进行编译并上传

5. 自动提交到pip库内

这样的话 你的包就可以直接pip install 了!想想都觉得成就感(当然 是有意义的哈 别push了一堆example hahaha)【reference link】

但是通常来说我们会使用github去自动完成这个步骤,那么需要了解:

  • github repo下的 secrets 添加
  • github action的工作流程 官方文档
- name: Publish package to TestPyPI
  uses: pypa/gh-action-pypi-publish@release/v1
  with:
    password: ${{ secrets.TEST_PYPI_API_TOKEN }}
    repository-url: https://test.pypi.org/legacy/
  • example 参考文档

主要注意的是多平台的支持就需要满足很多coding的严格限制,比如 写这篇的时候 ubuntu迅速通过并push 然而多平台 window macos一直报错

  1. C++版本要约束好在CMakeLists.txt,特别是使用的库是17的新功能
  2. 头文件不要拉,比如 array 头文件在ubuntu落了不报错 正常运行 但是其他两个就不行
  3. 模板类的一系列都要指定好 不能想着让系统自己figure out

以上,更多可以看 https://github.com/KTH-RPL/dztimer 这个repo的心路历程… commit都没删

TestPyPI是一个PyPI的分支类似于大家专门先在这里测试一下 然后确认好了 再走到PyPI,两者唯一的区别就是你token给哪个平台的 其余都是一模一样的操作

finally 欢迎大家star 并尝试 python dztimer 希望是一个好用的timing方案


赠人点赞 手有余香 😆;正向回馈 才能更好开放记录 hhh

本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如若转载,请注明出处:http://www.coloradmin.cn/o/1235768.html

如若内容造成侵权/违法违规/事实不符,请联系多彩编程网进行投诉反馈,一经查实,立即删除!

相关文章

重生之我是一名程序员 37

哈喽啊大家晚上好&#xff01; 今天呢给大家带来一个烧脑的知识——C语言中的栈溢出问题。那什么是栈溢出呢&#xff1f;栈溢出指的是当程序在执行函数调用时&#xff0c;为了保护函数的局部变量和返回地址&#xff0c;将这些数据存储在栈中。如果函数在函数调用时使用了过多的…

基于SSM的进销存管理系统设计与实现

末尾获取源码 开发语言&#xff1a;Java Java开发工具&#xff1a;JDK1.8 后端框架&#xff1a;SSM 前端&#xff1a;采用JSP技术开发 数据库&#xff1a;MySQL5.7和Navicat管理工具结合 服务器&#xff1a;Tomcat8.5 开发软件&#xff1a;IDEA / Eclipse 是否Maven项目&#x…

letcode::最小栈

最小栈 设计一个支持 push &#xff0c;pop &#xff0c;top 操作&#xff0c;并能在常数时间内检索到最小元素的栈。 实现 MinStack 类: MinStack() 初始化堆栈对象。void push(int val) 将元素val推入堆栈。void pop() 删除堆栈顶部的元素。int top() 获取堆栈顶部的元素。…

Mybatis系列之 parameterMap 弃用了

我 | 在这里 &#x1f575;️ 读书 | 长沙 ⭐软件工程 ⭐ 本科 &#x1f3e0; 工作 | 广州 ⭐ Java 全栈开发&#xff08;软件工程师&#xff09; &#x1f383; 爱好 | 研究技术、旅游、阅读、运动、喜欢流行歌曲 &#x1f3f7;️ 标签 | 男 自律狂人 目标明确 责任心强 ✈️公…

nginx-编译安装-基础指令-信号

nginx 的编译与安装 nginx目录介绍 如果我们需要整合第三方模块&#xff0c;需要自己编译然此模块编译到nginx里面。apt和yum的安装只具有常用的基础功能。 下载nginx wget http://nginx.org/download/nginx-1.14.0.tar.gz/auto 目录 Changes 描述了一每个版本提供了那些特…

leetcode:环形链表

题目描述 题目链接&#xff1a;141. 环形链表 - 力扣&#xff08;LeetCode&#xff09; 题目分析 我们先了解一个知识&#xff1a;循环链表 尾结点不指向NULL&#xff0c;指向头就是循环链表 那么带环链表就意味着尾结点的next可以指向链表的任意一个结点&#xff0c;甚至可…

2024年测试工程师必看系列之Requests_模块_知识点总结

【文章末尾给大家留下大量的福利喔】 1&#xff0c;导入requests模块 get请求&#xff1a; url host https://www.baidu.com/s headers {User-Agent: Mozilla/5.0 (Windows NT 10.0; Win64; x64) AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko) Chrome/90.0.4430.93 Safari/537.…

Java --- JVM之垃圾回收相关知识概念

目录 一、System.gc() 二、内存溢出与内存泄漏 2.1、内存溢出 2.2、内存泄漏 三、Stop the world 四、垃圾回收的并行与并发 4.1、并发 4.2、并行 4.3、并行 vs 并发 4.4、垃圾回收的并发与并行 五、安全点与安全区域 5.1、安全点 5.2、安全区域 六、引用 6.1…

开发上门洗衣洗鞋小程序都需要考虑哪些经营场景

互联网的高速发展让很多行业都转变了传统的服务模式&#xff0c;很多需要到店的服务都提供了上门的服务方式&#xff0c;洗护行业也是如此&#xff0c;越来越多的城市都开始流行上门洗衣洗鞋&#xff0c;要做上门的服务模式的话&#xff0c;就需要有一个小程序为载体&#xff0…

点击这里,获取数据治理加速器!

数据管理员&#xff1a;又双叒叕…盘一遍数据&#xff0c;这种工作究竟还要重复多少次&#xff1f;&#xff01; • 上上个月&#xff0c;发现数据有些问题&#xff0c;我把数据盘了一遍&#xff0c;梳理完数据的关联表才定位到问题&#xff1b; • 上个月&#xff0c;进行数据…

redis之高可用

&#xff08;一&#xff09;redis之高可用 1、在集群当中有一个非常重要的指标&#xff0c;提供正常服务的时间的百分比&#xff08;365天&#xff09;99.9% 2、redis的高可用的含义更加广泛&#xff0c;正常服务是指标之一&#xff0c;数据容量的扩展、数据的安全性 3、在r…

ueditor整合到thinkPHP里

<?phpnamespace app\ueditor\controller;use think\Controller;class Ueditor extends Controller {//首页public function upload(){//header(Access-Control-Allow-Origin: http://www.baidu.com); //设置http://www.baidu.com允许跨域访问//header(Access-Control-Allow…

2023亚太杯数学建模思路 - 案例:最短时间生产计划安排

文章目录 0 赛题思路1 模型描述2 实例2.1 问题描述2.2 数学模型2.2.1 模型流程2.2.2 符号约定2.2.3 求解模型 2.3 相关代码2.4 模型求解结果 建模资料 0 赛题思路 &#xff08;赛题出来以后第一时间在CSDN分享&#xff09; https://blog.csdn.net/dc_sinor?typeblog 最短时…

使用JMX监控ZooKeeper和Kafka

JVM 默认会通过 JMX 的方式暴露基础指标,很多中间件也会通过 JMX 的方式暴露业务指标,比如 Kafka、Zookeeper、ActiveMQ、Cassandra、Spark、Tomcat、Flink 等等。掌握了 JMX 监控方式,就掌握了一批程序的监控方式。本节介绍 JMX-Exporter 的使用,利用 JMX-Exporter 把 JMX…

ODBC配置数据源及相关问题(“找不到工程和库”“实时错误91对象变量或with块变量未设置”等)

目录 背景遇到的问题及解决步骤1、找不到工程和库问题分析问题解决 2、 实时错误91&#xff0c;对象变量或with块变量未设置问题分析问题解决 3、文件dsn配置问题什么是dsn文件&#xff0c;内容是什么&#xff0c;作用是什么ODBC配置dsn文件配置文件dsn默认路径ODBC 32位和64位…

股票统计信息(七)

7-统计信息 文章目录 7-统计信息一. 股票周级别统计信息二. 查询可支持的所有的股票资金类型三. 股票图形统计信息四. 查询当前用户自选表里面最近十天的交易信息五. 查看天/星期范围统计的历史记录六. 查看最近多少天某个属性的涨跌幅度值 一. 股票周级别统计信息 接口描述: …

【Spring】使用xml配置AOP

文章目录 1.前言2.xml配置AOP3. 总结 1.前言 在之前的学习中,都是使用注解的方式进行AOP的配置.其实使用xml配置文件也可以配置AOP. 2.xml配置AOP xml配置AOP方法如下: 添加相关依赖 <dependencies><dependency><groupId>org.springframework</groupId…

数学建模之插值法及代码

发现更多知识&#xff0c;欢迎访问Cr不是铬的个人网站 引言 数模比赛中&#xff0c;常常需要根据已知的函数点进行数据、模型的处理和分析&#xff0c;而有时候现有的数据是极少的&#xff0c;不足以支撑分析的进行&#xff0c;这时就需要使用一些数学的方法&#xff0c;“模…

www.testfire.nets渗透测试报告

www.testfire.nets渗透测试报告 一、测试综述 1.1.测试⽬的 通过实施针对性的渗透测试&#xff0c;发现testfire.net⽹站的安全漏洞&#xff0c;锻炼自己的渗透水平 1.2.测试范围 域名&#xff1a;www.testfire.net IP:65.61.137.117 测试时间&#xff1a; 2023年11月…