SpatialFeaturePlot画图是空的

news2024/11/16 10:49:48

st@meta.data=dplyr::left_join(st@meta.data,coor[,c(3,7:8)],by="barcodes")

SpatialFeaturePlot(st,features = "test",images = "P02")

做了上述操作之后画出的图是空的

原因,left_join之后自动把st@meta.data的行名变成了1,2,3.....

将行名换回barcodes名即可

st@meta.data$barcodes=rownames(st@meta.data$barcodes)

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