Galaxy生信云|新增生存曲线绘制、肿瘤基因通路注释工具

news2024/11/16 19:43:41

2023-10-26,Galaxy生信云平台 UseGalaxy.cn 新增 2 个工具。

Cancer Research

  • 生存曲线 Kaplan-Meier curve ploter

  • 肿瘤通路注释 Gene to oncogenic pathway mapper

部分结果展示

生存曲线 Kaplan-Meier curve ploter

生存曲线-不分层:

b65c201ba1f7fe7a1f9527d1f4c5e248.jpeg

生存曲线-分层:

50ae89b5e6c8cfd2dfc169cc4903bb9c.jpeg

生存分析是一种统计方法,用于评估特定群体在一段特定时间内存活或生存的概率。它通常用于研究患者的生存率或存活时间,特别是在临床医学和流行病学研究中。生存分析主要涉及观察患者或个体在一定时间内是否存活,并在研究过程中考虑各种可能的因素,如治疗方法、药物治疗、生活方式等。

肿瘤通路注释 Gene to oncogenic pathway mapper

指定基因所在的列,本工具可以将基因名转换成通路名(TCGA 10 条oncogenic通路和 TCGA 10 条DDR通路)。

注释前:

1ec4d4c6761e5f6e5ff12754599f75be.jpeg

注释后:

437e354f25f23b8476c78a95db97025e.jpeg

TCGA 10 条 oncogenic 通路:

  • Cell_Cycle

  • Hippo

  • MYC

  • NOTCH

  • NRF2

  • PI3K

  • TGF_Beta

  • RTK_RAS

  • TP53

  • WNT

TCGA 10 条 DDR 通路:

  • BER

  • DR

  • NHEJ

  • NER

  • MMR

  • HR

  • TLS

  • FA

  • NP

  • Other

最后

谁不想点点鼠标就把活儿干了,早点下班不好吗?

Galaxy生信云平台 usegalaxy.cn 致力于降低生信分析门槛,将许多常见的生信分析都放到云上,用户无需安装本地软件或R包,只需要上传数据,点击鼠标即可进行生信分析

本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如若转载,请注明出处:http://www.coloradmin.cn/o/1139288.html

如若内容造成侵权/违法违规/事实不符,请联系多彩编程网进行投诉反馈,一经查实,立即删除!

相关文章

封装, 继承, 多态详解

面向对象编程有三大特征:封装、继承和多态 一.封装 思维导图概览: 1. 封装的概念 —— 把抽象出的数据(属性)和对数据的操作(方法)封装到一起,数据被保护在内部,程序的其它部分只有…

linux系统 too many open files解决方法

1.遇到的问题 too many open files是Linux系统中常见的错误,从字面意思上看就是说程序打开的文件数过多,不过这里的files不单是文件的意思,也包括打开的通讯链接(比如socket),正在监听的端口等等,所以有时候也可以叫做…

Python 中的邻接矩阵

Python 中使用图数据结构来表示各种现实生活中的对象,例如网络和地图。 我们可以使用邻接矩阵来表示图。 本文将讨论在 Python 中实现邻接矩阵的不同方法。 创建邻接矩阵 考虑下图。 图中,有 6 个节点,编号为 1 到 6。图中连接节点的边有 7 条; 边 eij 连接节点 i 和节点…

2023年中国儿童滑板车优点、市场规模及发展前景分析[图]

儿童滑板车行业是指专门生产、销售和服务于儿童滑板车的行业。儿童滑板车是一种两轮滑行车,通常由车架、轮子、刹车和把手等部件组成。儿童滑板车是一种受欢迎的户外运动和娱乐工具,可以帮助儿童锻炼身体、提高平衡和协调能力,同时也是一种时…

无人机真机搭建问题记录文档(待续)

搭建问题 问题1 高飞课程中的飞控停产,更换飞控(pixhawx 6c)出现如下问题 1、飞控太大造成安装机载电脑的碳板上的孔被挡住。 2、课程提供的飞控固件,与更换的飞控不匹配 解决办法 1、现在的无人机碳板上只安装三个螺纹孔&…

如何平衡需求变更与项目进度冲突问题?

需求变更往往会对项目进度产生影响,可能会导致项目进度的重新评估、调整和重新开发已有功能,从而延长交付时间。如果忽视拒绝需求变更,会导致客户的不满和冲突。 因此如何更好地平衡两者间的冲突问题,迫在眉睫。一般来说&#xff…

【Unity ShaderGraph】| 制作一个 高级流体水球效果

前言 【Unity ShaderGraph】| 快速制作一个 流体水球效果一、效果展示二、简易流体水球效果三、进阶流体水球效果四、应用实例 前言 本文将使用ShaderGraph制作一个 高级流体水球 ,可以直接拿到项目中使用。对ShaderGraph还不了解的小伙伴可以参考这篇文章&#xf…

8.MySQL内外连接

个人主页:Lei宝啊 愿所有美好如期而遇 目录 表的内连和外连 内连接 外连接 左外连接 右外连接 我们进行演示的表结构是这样的: 表的内连和外连 内连接 内连接实际上就是利用where子句对两种表形成的笛卡儿积进行筛选,我们前面学习的…

Vue3项目创建+组合式API使用+组件通信+渲染微博热搜+打包上线

摘要 Vue3的组合式API大大减少了代码量,以及使用也方便了很多,本案例使用Vite创建一个Vue3示例,简单介绍Vue3的组合式API使用以及父传子组件传参示例。 创建Vue3项目 1、首先要安装 Node.js 下载地址:https://nodejs.org/en/do…

css-物联网管理界面

效果图: 分享链接: monitor https://www.aliyundrive.com/s/CkLVqXcnJFc 点击链接保存,或者复制本段内容,打开「阿里云盘」APP ,无需下载极速在线查看,视频原画倍速播放。

qt 双击可执行文件提示没有平台插件Qt platform plugin

准备打包可执行文件时,双击可执行文件 报错提示: 解决办法: 从qt安装目录下拷贝platforms文件夹,放在你要执行的可执行目录里。

App在哪里可以免费内测分发?

当ios开发者开发完成ios App后,往往要进入内测或公测阶段,需要进行分发,测试用户才能下载应用。 App分发平台是许多app开发类企业经常使用的平台,将主要开发的app上传到app分发平台上进行内测下载。很多开发者服务平台其实是提供…

SDRAM学习笔记(MT48LC16M16A2,w9812g6kh)

一、基本知识 SDRAM : 即同步动态随机存储器(Synchronous Dynamic Random Access Memory), 同步是指其时钟频率与对应控制器(CPU/FPGA)的系统时钟频率相同,并且内部命令 的发送与数据传输都是以该时钟为基准&#xff…

Python中if __name__ == ‘__main__‘,__init__和self 的解析

一、 if __name__ __main__ if __name__ __main__的意思是: 当.py文件被直接运行时,if __name__ __main__之下的代码块将被运行; 当.py文件以模块形式被导入时,if __name__ __main__之下的代码块不被运行。 1.1、一个 xxx.p…

面试题复盘-2023/10/20

目录 笔试题面试题(未完待续) 笔试题 一.多选题 A:map的key是const,不可更改 B:STL中的快速排序比一般的快速排序速度更快,是因为中值排序法 C:list的插入效率是O(1) D:vector的容量只能增大不能减小 解析: B: STL中的sort函数的…

Python教程总结版

目录 1. chr()和ord()的用法 2. input()——读取数据的转换 2.1 int(),float(),list() 数据转换 2.2 split()函数处理多个输入值 2.3 map()强制转换 1. chr()和ord()的用法 for i in range(65, 91): print(chr(i), end) # 控制台输出:ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUV…

关于高并发你必须知道的几个概念

🎈个人公众号:🎈 :✨✨✨ 可为编程✨ 🍟🍟 🔑个人信条:🔑 为与不为皆为可为🌵 🍉本篇简介:🍉 本篇记录高并发必须知道的几个概念,如有出入还望指正。 关注公众…

墨西哥专线港口通航情况

随着全球贸易的不断发展,墨西哥作为拉美地区的重要国家,其港口通航状况对于国际贸易具有重要意义。本文将从墨西哥专线港口的通航现状、通航瓶颈以及未来发展趋势等方面进行分析,以期为墨西哥港口的发展提供一些参考。 一、墨西哥专线港口的通…

使用Linux JumpServer 堡垒机进行远程访问

文章目录 前言1. 安装Jump server2. 本地访问jump server3. 安装 cpolar内网穿透软件4. 配置Jump server公网访问地址5. 公网远程访问Jump server6. 固定Jump server公网地址 前言 JumpServer 是广受欢迎的开源堡垒机,是符合 4A 规范的专业运维安全审计系统。JumpS…

有什么不起眼,却很挣钱的副业?

说两个真人真事儿: 1、我有一个表妹,去年生完孩子后,开始在家做视频剪辑工作。 主要是剪辑一些古装剧、家庭剧等视频,然后发布到抖音和快手等短视频平台。 她会把视频剪辑成一集一集的,先发布片段进行推广,如果用户觉得剧情吸引就提示他们可以付费购买全集。 我表妹…