Galaxy生信云|新增生存曲线绘制、肿瘤基因通路注释工具

news2024/10/6 2:25:16

2023-10-26,Galaxy生信云平台 UseGalaxy.cn 新增 2 个工具。

Cancer Research

  • 生存曲线 Kaplan-Meier curve ploter

  • 肿瘤通路注释 Gene to oncogenic pathway mapper

部分结果展示

生存曲线 Kaplan-Meier curve ploter

生存曲线-不分层:

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生存曲线-分层:

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生存分析是一种统计方法,用于评估特定群体在一段特定时间内存活或生存的概率。它通常用于研究患者的生存率或存活时间,特别是在临床医学和流行病学研究中。生存分析主要涉及观察患者或个体在一定时间内是否存活,并在研究过程中考虑各种可能的因素,如治疗方法、药物治疗、生活方式等。

肿瘤通路注释 Gene to oncogenic pathway mapper

指定基因所在的列,本工具可以将基因名转换成通路名(TCGA 10 条oncogenic通路和 TCGA 10 条DDR通路)。

注释前:

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注释后:

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TCGA 10 条 oncogenic 通路:

  • Cell_Cycle

  • Hippo

  • MYC

  • NOTCH

  • NRF2

  • PI3K

  • TGF_Beta

  • RTK_RAS

  • TP53

  • WNT

TCGA 10 条 DDR 通路:

  • BER

  • DR

  • NHEJ

  • NER

  • MMR

  • HR

  • TLS

  • FA

  • NP

  • Other

最后

谁不想点点鼠标就把活儿干了,早点下班不好吗?

Galaxy生信云平台 usegalaxy.cn 致力于降低生信分析门槛,将许多常见的生信分析都放到云上,用户无需安装本地软件或R包,只需要上传数据,点击鼠标即可进行生信分析

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