amber14自由能计算及增强采样方法

news2024/12/25 4:56:56

1分子力学简介
1.1分子力学的基本假设
1.2分子力学的主要形式
2分子力场
2.1分子力场的简介
2.2分子力场的原理
分子力场的分类及应用
二.LINUX入门
教学目标:掌握数值计算平台,熟悉计算机语言,能够使用vim编辑器简单编辑文件。
3LINUX 简介
3.1用户属组及权限
3.2目录文件属性
3.3LINUX基础命令
3.4LINUX环境变量
shell常用命令练习
4AMBER简介和安装
4.1GCC简介及安装
4.2Open MPI简介及安装
4.3AMBER安装运行
LIUUX操作练习
5模型文件的预处理
5.1模型来源简介
蛋白文件简介
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